Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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NDUFA9Q16795 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
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