Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC092941.2-201ENST00000444379 1008 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC093827.1-201ENST00000480094 861 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 HGNC:24955-208ENST00000521585 1260 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC244131.2-201ENST00000612592 512 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MTCO1P1-201ENST00000624263 1081 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PHLDB2-214ENST00000495180 4159 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR52B3P-201ENST00000314715 928 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CBX1P5-201ENST00000475330 559 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 ENPP7P11-201ENST00000505915 627 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AD000090.1-201ENST00000638356 494 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 NSUN3-201ENST00000314622 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 MOBP-203ENST00000415443 577 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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SIX1Q15475 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC079015.1-201ENST00000521793 596 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC100784.1-201ENST00000522790 310 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SIX1Q15475 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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