Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PSG7-202ENST00000446844 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AMELX-201ENST00000348912 737 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 NUDT5-203ENST00000378940 1126 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC092646.1-201ENST00000427142 901 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC007679.3-201ENST00000434035 414 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ST3GAL3-232ENST00000531451 420 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SLC25A51P2-201ENST00000535708 889 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC018946.1-201ENST00000560578 458 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC011891.2-201ENST00000604949 397 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MIR6070-201ENST00000613967 103 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL161457.2-202ENST00000629161 743 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR4D11-201ENST00000313253 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RNA5SP326-201ENST00000363209 110 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL138828.1-204ENST00000413745 898 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC007966.1-201ENST00000421998 1179 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RIMKLBP2-201ENST00000424737 654 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC245291.3-201ENST00000443400 292 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SMCO1Q147U7 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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