Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC097717.1-233ENST00000413557 460 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL139294.1-201ENST00000435739 512 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 TXNP2-201ENST00000443918 295 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL158068.1-201ENST00000506116 616 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL133481.2-201ENST00000538322 367 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC022387.2-201ENST00000604050 448 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC01050-201ENST00000604485 760 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 CCDC195-201ENST00000638102 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PRKCH-228ENST00000640011 285 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ERBIN-208ENST00000506030 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 TTBK2-201ENST00000267890 10905 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RNA5SP433-201ENST00000364491 114 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AC092266.1-201ENST00000610958 165 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
NPRL3Q12980 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms