Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RNF19BPX-201ENST00000426224 625 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 MTCO3P43-201ENST00000440974 771 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RPL37AP8-201ENST00000494116 276 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC020923.1-201ENST00000624021 917 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 GPATCH11-201ENST00000281932 3570 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 CCL8-201ENST00000394620 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 USP9YP19-201ENST00000412165 485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC007298.1-201ENST00000547346 656 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 CEACAMP10-201ENST00000489959 1721 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
NIPAL4Q0D2K0 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83 ms