Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PRH2-201ENST00000381847 641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC092634.4-201ENST00000419937 423 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RNF219-AS1-202ENST00000444769 590 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR4G1P-202ENST00000641173 1788 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RMST-209ENST00000639542 3269 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC007327.2-201ENST00000440788 457 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SLC7A7-210ENST00000554517 1158 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL354950.1-201ENST00000614150 568 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC027279.4-201ENST00000624371 2072 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 TET1P1-201ENST00000426627 2301 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 RPL7P56-201ENST00000429441 717 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ACADSBP45954 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms