Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AGGF1P3-201ENST00000493675 1213 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 IMPA1P1-201ENST00000510718 842 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AP001372.3-201ENST00000530510 609 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC007346.1-201ENST00000569208 867 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 NPM1P39-201ENST00000449818 867 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01961-201ENST00000449954 745 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 LINC02114-201ENST00000503757 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 LINC00506-201ENST00000628435 525 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZCWPW2-201ENST00000383768 1716 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RPL17-C18orf32-203ENST00000584895 1440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
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CASQ1P31415 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RBMY2HP-201ENST00000457961 720 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 H3F3AP5-201ENST00000475267 429 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 PWRN1-207ENST00000565893 818 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC005323.1-203ENST00000585303 566 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CASQ1P31415 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
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