Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 AC037198.3-201ENST00000616754 526 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 OR52A5-202ENST00000642125 3993 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RORA-203ENST00000335670 10844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 BNIP3P32-201ENST00000600015 554 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 PDE4D-226ENST00000546160 7690 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC097515.1-202ENST00000511818 371 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC131953.1-201ENST00000513127 477 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 HMGN2P6-201ENST00000551091 273 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC039056.1-201ENST00000552704 467 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 DARS-AS1-220ENST00000607985 660 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RPSAP73-201ENST00000614820 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 NCOA4P2-201ENST00000340589 1813 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 CR383656.5-201ENST00000547616 1340 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 CASC1-201ENST00000320267 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC079858.1-201ENST00000507842 448 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
POLKQ9UBT6 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms