Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 AC245047.2-201ENST00000441060 530 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RN7SL222P-201ENST00000476452 299 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC105420.1-201ENST00000504389 582 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC145141.1-201ENST00000510180 567 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 KLRD1-209ENST00000543420 802 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 OR1AB1P-201ENST00000585564 761 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC027449.1-201ENST00000608890 407 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 IARS-213ENST00000627121 4587 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 ZNF793-202ENST00000542455 4073 ntTSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC7.06□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 ACACA-231ENST00000614428 9554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 GCNT6-201ENST00000379591 934 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC015971.1-204ENST00000424788 1147 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 LYRM4-208ENST00000500576 592 ntTSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC010230.1-201ENST00000514115 443 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC008250.1-201ENST00000539874 522 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 Metazoa_SRP.55-201ENST00000618452 275 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 C5orf34-201ENST00000306862 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
SYNE4Q8N205 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms