Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 ARSFP1-201ENST00000398758 477 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 CABYR-204ENST00000399499 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL645465.1-201ENST00000417765 642 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 WDR82P2-201ENST00000444540 928 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL050338.1-201ENST00000445585 786 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL450263.1-202ENST00000453199 643 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC022730.1-201ENST00000473114 568 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC015524.1-201ENST00000491585 472 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC095052.1-201ENST00000509955 863 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC011396.2-201ENST00000515598 582 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ATG16L1Q676U5 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ATG16L1Q676U5 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ATG16L1Q676U5 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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ATG16L1Q676U5 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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ATG16L1Q676U5 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 ANTXR2-204ENST00000404191 1469 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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ATG16L1Q676U5 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 UBTFL2-201ENST00000411859 1191 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 LINC00707-201ENST00000436383 3070 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC079117.1-201ENST00000445178 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL450345.1-201ENST00000456118 311 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 RN7SL552P-201ENST00000462094 276 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 SUCLG2-AS1-203ENST00000496640 862 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
ATG16L1Q676U5 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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