Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01955-201ENST00000626392 792 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL596275.2-207ENST00000641188 675 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 TEDDM1-201ENST00000367565 2500 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC005261.6-201ENST00000623072 1387 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 IFIT1P1-201ENST00000400497 1449 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SNORA64.1-201ENST00000362600 132 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RN7SL168P-201ENST00000463821 279 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MIR4307HG-201ENST00000548170 822 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
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RTL8BQ17RB0 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RPS2P45-201ENST00000469997 2057 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SCAMP1-206ENST00000618166 1358 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC02203-203ENST00000625989 1600 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 PSD3-201ENST00000286485 6665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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RTL8BQ17RB0 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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RTL8BQ17RB0 IREB2-201ENST00000258886 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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RTL8BQ17RB0 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTL8BQ17RB0 Vault.2-201ENST00000516519 98 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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