Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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SS18Q15532 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
SS18Q15532 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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