Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC068631.1-205ENST00000455926 409 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 IQCJ-SCHIP1-AS1-201ENST00000460574 508 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 NMNAT1P5-201ENST00000559657 841 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MIR6839-201ENST00000620425 113 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LINC01798-204ENST00000433396 682 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 NOP56P2-201ENST00000447491 769 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 NDUFB2-210ENST00000475276 539 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC006499.4-201ENST00000510947 694 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 NUF2-202ENST00000367900 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC099673.1-201ENST00000452199 2296 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 GCSAML-202ENST00000366489 4030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ZNF214-204ENST00000536068 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC007618.1-201ENST00000366455 732 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL358178.1-201ENST00000407698 397 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms