Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 AL121989.1-201ENST00000585888 746 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
PTCH1Q13635 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 KMT2A-213ENST00000534358 16602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 PMCHL2-202ENST00000450213 1917 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC211486.3-201ENST00000412694 621 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 OR8D4-201ENST00000321355 1331 ntAPPRIS P1 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
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PTCH1Q13635 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
PTCH1Q13635 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
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