Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC026979.4-201ENST00000606555 645 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC211433.2-201ENST00000608433 387 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 WDR35-201ENST00000281405 6918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CLEC6A-201ENST00000382073 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SLC17A4-202ENST00000397076 2331 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PSD3-219ENST00000614430 6136 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 KLRC3-202ENST00000396439 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC006055.1-201ENST00000432423 411 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 FCF1P6-201ENST00000456841 595 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC068775.2-201ENST00000539033 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC135983.2-201ENST00000604301 628 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC092902.2-219ENST00000608488 822 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AP000864.1-201ENST00000609424 650 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 LNX2-201ENST00000316334 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ADCY10-205ENST00000545172 4966 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL033543.1-201ENST00000623440 13454 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
SEMA3BQ13214 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC6.09□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.44
SEMA3BQ13214 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms