Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 C21orf62-202ENST00000479548 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC110275.1-201ENST00000534420 623 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 STARD13-AS-208ENST00000589472 859 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RYR3-201ENST00000389232 15552 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC017048.1-201ENST00000412153 495 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 EIF4A1P7-201ENST00000421800 1220 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PHC3-208ENST00000481639 1075 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 CNGA1-207ENST00000514170 2837 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 OR6E1P-201ENST00000414424 923 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AC022140.1-201ENST00000511029 565 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AP003059.1-201ENST00000526206 432 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms