Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 OR1E1-201ENST00000322608 1307 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF66-202ENST00000360204 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL096711.1-201ENST00000404780 554 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF37CP-201ENST00000406795 241 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC012519.1-201ENST00000424588 610 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 GPRC5D-AS1-205ENST00000540198 404 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 FRMD6-AS2-201ENST00000556617 548 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AC083964.1-201ENST00000607549 630 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 MIR6809-201ENST00000612189 116 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IFFO1Q0D2I5 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 NAT1-208ENST00000520546 1446 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 SULT1C3-201ENST00000329106 915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 OR13Z1P-201ENST00000416141 834 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 ZNF880-203ENST00000424032 558 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 HTR5BP-202ENST00000434708 1193 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC011752.1-201ENST00000451476 494 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP441-201ENST00000516809 88 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 TRIM37-212ENST00000584889 353 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC083798.2-201ENST00000608756 1152 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 U91328.4-201ENST00000608919 517 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 MCM3AP-AS1-204ENST00000432735 2302 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 WDR5B-201ENST00000330689 3720 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 HSPD1P9-201ENST00000420325 1636 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RN7SKP146-201ENST00000410242 334 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 XIST-201ENST00000416330 750 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AL389925.1-201ENST00000432257 728 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 NUCB2-202ENST00000458064 1279 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
IFFO1Q0D2I5 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.6 ms