Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 IGKV1OR22-5-201ENST00000458718 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC026688.1-201ENST00000520639 1168 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 SKA2-207ENST00000583380 583 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ZNF507-203ENST00000544431 5764 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ASAH1-267ENST00000637991 2399 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CASC19-205ENST00000641013 1411 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 TOX-201ENST00000361421 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
CEP290O15078 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
CEP290O15078 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
CEP290O15078 AC092807.3-203ENST00000467530 2745 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
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CEP290O15078 ARHGEF12-201ENST00000356641 6891 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CEP290O15078 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CEP290O15078 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CEP290O15078 C14orf166-201ENST00000261700 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CEP290O15078 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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