Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC183089.2-201ENST00000637931 916 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC01968-202ENST00000423318 3647 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 DAZ3-202ENST00000382365 3503 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ACACA-226ENST00000612895 9624 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 UPF2-203ENST00000397053 5369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AIMP1-203ENST00000442366 2519 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 KPNB1-203ENST00000540627 2989 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC092451.3-201ENST00000625067 1343 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LRRC37B-203ENST00000394713 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SMC1A-201ENST00000322213 9784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC104837.1-201ENST00000444644 1587 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC092821.2-201ENST00000545710 2042 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL023495.1-201ENST00000413005 1923 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SLC36A4-206ENST00000529184 1917 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ARHGAP28-201ENST00000262227 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CYP4F32P-201ENST00000426492 504 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC002486.2-201ENST00000447806 590 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RPL23AP64-201ENST00000469465 435 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC104689.1-201ENST00000473356 768 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC020980.1-201ENST00000513041 458 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL513218.1-201ENST00000606527 391 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC012594.1-272ENST00000625790 710 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP2B1-222ENST00000628168 192 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP005139.1-201ENST00000580702 1647 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AC061975.7-201ENST00000592016 2692 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 STS-201ENST00000217961 6521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 PCDH15-231ENST00000617271 6425 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ANK2-212ENST00000506722 8051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 NBPF9-206ENST00000613969 4624 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 GSTM2-207ENST00000460717 1449 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LCP1-202ENST00000398576 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SMAD1-202ENST00000394092 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ATP8B5P-203ENST00000430846 3962 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 SIRPG-AS1-202ENST00000456177 2795 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ATP5S-202ENST00000311459 10212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 AP002991.2-201ENST00000623807 2801 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 ZNF474-201ENST00000296600 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 BMX-201ENST00000342014 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 CNTRL-207ENST00000373855 7660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
RFXAPO00287 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 167.2 ms