Protein–RNA interactions for Protein: D6R9N7

USP17L18, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L18D6R9N7 AC234771.2-201ENST00000445718 597 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 EEF1B2P3-201ENST00000447718 678 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL590032.1-201ENST00000604920 252 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC004908.1-201ENST00000606572 541 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC061999.1-201ENST00000624454 177 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 FAM72B-201ENST00000355228 1773 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 IGF1R-206ENST00000558762 11726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AKR1C2-201ENST00000380753 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC034111.1-201ENST00000562143 3770 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RIPOR2-207ENST00000540914 3614 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MAPK10-380ENST00000642015 3137 ntAPPRIS P2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RAI14-220ENST00000512629 2941 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ZFYVE9-204ENST00000371591 4874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 LINC01492-201ENST00000411575 3738 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 OR1L1-201ENST00000309623 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AKAP14-201ENST00000334356 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PLAC1-201ENST00000359237 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 OR1L1-202ENST00000373686 1083 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PIGP-204ENST00000399102 688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 VIM2P-201ENST00000402383 1294 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC002069.1-201ENST00000429649 1159 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL138767.3-201ENST00000438082 495 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC089983.1-201ENST00000549807 701 ntTSL 3 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC005519.1-201ENST00000554490 601 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 NUDT7-206ENST00000568787 678 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 HNRNPA3P9-201ENST00000604913 979 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC004948.1-201ENST00000609858 672 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CCDC102B-210ENST00000584156 1554 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 DLG2-209ENST00000418306 3027 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 PGAP1-201ENST00000354764 11114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 CTNND1-233ENST00000532787 5751 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ATP1B4-203ENST00000539306 4644 ntTSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 AC104662.2-201ENST00000512921 1388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 ZNF806-201ENST00000438300 1774 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 OVAAL-201ENST00000442621 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
USP17L18D6R9N7 RBMS2-202ENST00000542360 1484 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 149 ms