Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 IGBP1P3-201ENST00000447449 1000 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 DAZ2-204ENST00000382431 3637 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 DNAJA1P4-201ENST00000406473 1166 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TPTE2P1-203ENST00000434100 514 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RBM28-201ENST00000223073 15507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 LIN7C-202ENST00000524596 4290 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 SUMO2P1-206ENST00000445436 284 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AP000470.1-201ENST00000448063 693 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 PAX8-AS1-202ENST00000422956 11799 ntTSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
ERVV-1B6SEH8 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms