Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MIR498-201ENST00000385134 124 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP18-201ENST00000390935 121 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP131-201ENST00000410698 301 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC118470.1-201ENST00000419891 453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 P3H2-203ENST00000427335 2963 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL035691.1-201ENST00000434562 595 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LSM3P3-201ENST00000436601 306 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC019117.1-204ENST00000451792 442 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL445187.1-201ENST00000502685 260 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC110716.1-201ENST00000506934 607 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC00967-204ENST00000518412 271 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC00964-204ENST00000528090 572 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC02384-207ENST00000542875 551 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC022239.4-201ENST00000602626 504 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC007262.1-201ENST00000604099 321 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NDUFB9P1-201ENST00000604683 510 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL139123.1-201ENST00000612008 430 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL121985.2-201ENST00000621192 555 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NR1I3-235ENST00000628566 1201 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PRPS1L1-202ENST00000638645 957 ntAPPRIS P2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 OR7C1-205ENST00000642030 11778 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CENPN-205ENST00000439957 1699 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL671511.1-201ENST00000425033 3458 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MAPK10-242ENST00000639242 3088 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A5-206ENST00000393727 2270 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ABCD3-202ENST00000370214 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 BDNF-217ENST00000533131 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ABI1-202ENST00000359188 3492 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NPL-212ENST00000614468 2376 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SPARCL1-201ENST00000282470 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 IFNK-201ENST00000276943 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP389-201ENST00000362610 115 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RNA5SP226-201ENST00000362653 115 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 CASP10-206ENST00000374650 1126 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL390195.1-202ENST00000416099 723 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AL157402.1-201ENST00000429469 363 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 WDR11-AS1-201ENST00000451706 1108 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 DAP3-209ENST00000465375 729 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 LINC00518-202ENST00000479822 906 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
CSPP1Q1MSJ5 AC023818.1-201ENST00000498379 384 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.9 ms