Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 RPS12P31-201ENST00000491419 398 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 EIF3KP3-201ENST00000514461 639 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC009623.1-201ENST00000517964 1131 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC016257.1-201ENST00000550088 641 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AL357060.1-201ENST00000638039 977 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ZNF410-211ENST00000555044 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 USP7-202ENST00000381886 3587 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 LINC00483-204ENST00000502517 940 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 UGDH-205ENST00000506179 3021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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SIX1Q15475 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
SIX1Q15475 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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