Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC023194.2-201ENST00000465398 406 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC122718.2-201ENST00000505325 591 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC018523.2-201ENST00000555531 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AL162464.1-201ENST00000557642 554 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC091167.5-201ENST00000605689 894 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 IKZF2-201ENST00000342002 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
SYCP1Q15431 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CFH-206ENST00000630130 1658 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SIAH1-202ENST00000380006 3352 ntAPPRIS P3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SKP171-201ENST00000364417 303 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC073130.1-202ENST00000454897 587 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC02217-201ENST00000505844 687 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC008413.2-201ENST00000507398 342 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LDHAP1-201ENST00000509421 992 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SCARNA18.1-201ENST00000516330 83 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CCND2-AS2-201ENST00000537370 495 ntTSL 4 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MOCS2-210ENST00000584946 736 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 FYB1-201ENST00000351578 4750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC104966.1-201ENST00000467010 1464 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
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SYCP1Q15431 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SCGB3A2-201ENST00000296694 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
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SYCP1Q15431 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 MRPL53P1-201ENST00000414323 319 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ATP6V1E1P1-201ENST00000439215 681 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC118758.1-202ENST00000454719 225 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 CREM-238ENST00000488741 651 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 SCGB3A2-202ENST00000504320 440 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 HSD3BP3-201ENST00000514706 994 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
SYCP1Q15431 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
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