Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 CENPK-210ENST00000510354 1124 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL4A6Q14031 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL4A6Q14031 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL4A6Q14031 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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COL4A6Q14031 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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COL4A6Q14031 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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COL4A6Q14031 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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