Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC084782.2-201ENST00000561934 839 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL078601.3-201ENST00000573303 535 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 DDX6-207ENST00000617381 2883 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ORC4-214ENST00000535373 6710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 HGF-205ENST00000423064 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CFHR4-203ENST00000367418 1066 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL139158.1-201ENST00000424719 340 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 C1orf143-201ENST00000443836 762 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC112187.1-201ENST00000455837 479 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 RN7SL362P-201ENST00000494228 267 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC010476.1-201ENST00000519111 851 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 5S_rRNA.29-201ENST00000641250 107 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CAPRIN2-202ENST00000395805 4156 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CBFBQ13951 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms