Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 CD47-201ENST00000355354 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 GABRG2-203ENST00000414552 3927 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGA9Q13797 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC012594.1-271ENST00000438635 736 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGA9Q13797 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGA9Q13797 AC079089.1-202ENST00000528800 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGA9Q13797 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGA9Q13797 AC002398.1-201ENST00000589397 427 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGA9Q13797 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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ITGA9Q13797 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC003991.1-201ENST00000594469 484 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC008395.1-201ENST00000601752 607 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 FAM49B-229ENST00000615041 750 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
ITGA9Q13797 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
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