Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZNF812P-201ENST00000457674 1694 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CTNND1-231ENST00000532463 5749 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 HOMEZ-203ENST00000561013 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RNA5SP373-201ENST00000517271 95 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MAL2-208ENST00000523307 556 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP002373.2-201ENST00000541631 1060 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PKIA-201ENST00000352966 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PPIL1-201ENST00000373699 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LUC7L2-201ENST00000263545 2287 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL354794.1-201ENST00000442103 516 ntTSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CCDC77-201ENST00000239830 2371 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 PHLDB2-201ENST00000393923 5673 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KCNN3-205ENST00000618040 13057 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 GRIK2-206ENST00000413795 4876 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LMNTD1-207ENST00000539744 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 C9orf57-202ENST00000424431 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL139819.1-201ENST00000429420 471 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC115989.1-202ENST00000452153 1150 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC010395.1-201ENST00000507627 697 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ARHGAP20-203ENST00000527598 5998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AZIN1-AS1-203ENST00000517996 756 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
CACNA1SQ13698 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
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