Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LINC01947-201ENST00000523742 566 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TRPC4-207ENST00000426868 2709 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LGALS8-222ENST00000527974 1349 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC103740.1-201ENST00000558888 7427 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 Z93019.1-201ENST00000416450 973 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC021876.1-201ENST00000425959 359 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC007386.1-201ENST00000455212 582 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RPL35AP19-201ENST00000469425 329 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL161752.1-201ENST00000557721 263 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 DHFRP1-201ENST00000579682 559 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC011444.3-201ENST00000588342 325 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MIR8080-201ENST00000622224 89 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC099811.1-201ENST00000597755 1496 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ANKS1B-216ENST00000549558 2268 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 ARID2-202ENST00000422737 5481 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
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CDH18Q13634 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 BPHL-201ENST00000380368 797 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 CSNK1A1P3-201ENST00000504105 330 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 BX510359.5-201ENST00000515651 304 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
CDH18Q13634 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
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