Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNA5SP234-201ENST00000363916 119 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC015923.1-201ENST00000435892 305 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 TRDV3-201ENST00000535880 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CCDC60-203ENST00000536742 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ELSPBP1-205ENST00000597519 557 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PCBP1-AS1-286ENST00000625888 765 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 NEMF-201ENST00000298310 6234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DECR1-215ENST00000522161 1766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 EEF1A1P30-201ENST00000429708 1315 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 HYAL4-202ENST00000476325 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR11H6-201ENST00000315519 993 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 GPRC5D-AS1-208ENST00000545914 566 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC015720.2-201ENST00000567709 334 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC103808.4-201ENST00000577258 391 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC026786.2-201ENST00000606110 392 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 Metazoa_SRP.207-201ENST00000612254 285 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
FOXF1Q12946 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms