Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AP001011.1-201ENST00000583546 690 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC090227.1-201ENST00000590532 936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 DARS-AS1-217ENST00000599279 544 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ZNF253-205ENST00000640599 1208 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ALKBH3-AS1-201ENST00000499194 1906 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RYR3-202ENST00000415757 15557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 SEC22A-201ENST00000309934 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 OR51A6P-201ENST00000418680 1004 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 AC104836.2-201ENST00000609675 1293 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 FAS-203ENST00000355279 983 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
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PGGT1BP53609 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 TOMM7-203ENST00000405021 455 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 PSMA3-202ENST00000412908 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
PGGT1BP53609 AL512625.3-204ENST00000438699 1031 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
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