Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC017002.1-201ENST00000432268 881 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC114982.2-201ENST00000461396 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 LINC02083-201ENST00000462835 515 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR4A43P-201ENST00000532938 908 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR7G1-201ENST00000541538 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 OR2L8-201ENST00000623922 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 SAMMSON-209ENST00000641222 1100 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 INTS6-203ENST00000442263 15428 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TMPOP42166 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TMPOP42166 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AP000547.3-204ENST00000588548 2523 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 RPL7P6-201ENST00000480903 738 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC012464.2-201ENST00000551257 779 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 USP3-AS1-202ENST00000559357 455 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 MIR1269B-201ENST00000580405 75 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 ST6GALNAC3-203ENST00000621530 617 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 SLC7A11-201ENST00000280612 9645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TMPOP42166 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 BICD1-204ENST00000548411 8811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 ARPP21-215ENST00000432682 1015 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 RPSAP41-201ENST00000439695 860 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TMPOP42166 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
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