Protein–RNA interactions for Protein: P19838

NFKB1, Nuclear factor NF-kappa-B p105 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 968 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB1P19838 AC108941.1-201ENST00000502853 530 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AK6-204ENST00000512561 587 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC083967.1-201ENST00000522354 515 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AP003548.1-201ENST00000523862 711 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC005832.3-201ENST00000537929 631 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ATP5J2P4-201ENST00000538774 267 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 TMEM132D-AS1-207ENST00000542535 442 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC130371.1-204ENST00000576197 401 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 MIR4470-201ENST00000583453 72 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC010463.3-201ENST00000594077 500 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC113361.1-201ENST00000606683 543 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC087633.2-208ENST00000612877 502 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC023158.2-201ENST00000614876 543 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL139254.2-202ENST00000641937 1156 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL596275.2-203ENST00000641951 371 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 TCF4-225ENST00000564999 3590 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL359922.2-201ENST00000581788 3017 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SLC2A3P2-201ENST00000331747 1480 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 PTK2-228ENST00000521059 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AC114401.1-201ENST00000484222 2084 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 AL359551.1-201ENST00000442726 2900 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 CLRN1-202ENST00000327047 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 KLHL2-202ENST00000421009 2452 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
NFKB1P19838 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FBXW7-201ENST00000263981 3743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC079178.2-201ENST00000439323 1624 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AP3M1-201ENST00000355264 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 HYAL4-201ENST00000223026 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ALMS1-207ENST00000614410 11700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 IGKV3D-11-201ENST00000390277 444 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC090114.1-201ENST00000393266 448 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01505-201ENST00000411451 686 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RPSAP1-201ENST00000421328 880 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LIX1L-AS1-203ENST00000421764 287 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 HCG25-217ENST00000422366 702 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL162726.1-201ENST00000436084 455 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 PRDX1P1-201ENST00000449329 596 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01795-201ENST00000454367 813 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL138787.2-201ENST00000466576 367 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC022973.2-201ENST00000520146 549 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 KCTD9P4-201ENST00000526766 1166 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 LINC01493-202ENST00000533575 581 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 FAM66C-206ENST00000535567 724 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 SYPL1P2-201ENST00000582878 727 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL589765.5-201ENST00000596133 515 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AC068802.1-201ENST00000603420 732 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 CT45A7-201ENST00000610598 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
NFKB1P19838 AP003789.1-201ENST00000617737 605 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 262.1 ms