Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TRMT13-202ENST00000370141 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PIGN-239ENST00000639902 4439 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 HSPD1P14-201ENST00000432666 1618 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 KLHL2-210ENST00000538127 2907 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC009501.3-201ENST00000605001 1352 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR56A4-201ENST00000330728 1209 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CXADRP1-201ENST00000398098 1095 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL031428.1-201ENST00000427154 666 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 IGLV3-4-201ENST00000432300 244 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL390879.1-201ENST00000439143 386 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL731574.1-201ENST00000447757 456 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP60-201ENST00000450011 454 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CT45A5-201ENST00000487941 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZFAND1-204ENST00000517588 633 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AZIN1-AS1-208ENST00000519257 619 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01320-205ENST00000604250 857 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC244196.4-201ENST00000611787 392 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 Metazoa_SRP.199-201ENST00000615501 281 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CXADRP3-202ENST00000617265 1100 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SOX9-AS1-218ENST00000628742 733 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 UBA3-213ENST00000631029 123 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC007603.3-201ENST00000636915 979 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 OR56A4-203ENST00000641279 1209 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC008691.1-209ENST00000642094 814 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TOP2B-201ENST00000264331 5358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ARHGEF38-201ENST00000265154 1437 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CLEC12A-203ENST00000355690 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
SH3BP4Q9P0V3 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99 ms