Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AFP-202ENST00000395792 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ARPP21-AS1-201ENST00000415706 542 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL390115.1-201ENST00000425271 423 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL136038.1-201ENST00000497246 351 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC02552-203ENST00000545630 583 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ETFRF1-208ENST00000556402 874 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL049779.3-201ENST00000557141 606 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 AC104461.1-201ENST00000637430 817 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 LINC01470-202ENST00000506723 2193 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ZNF548Q8NEK5 RBMS2-201ENST00000262031 8382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC022826.2-201ENST00000358757 776 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
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ZNF548Q8NEK5 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC011405.1-202ENST00000504658 803 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC021733.1-201ENST00000519786 325 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P36-201ENST00000529541 409 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC015802.2-201ENST00000589690 189 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
ZNF548Q8NEK5 RNF6-202ENST00000381570 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
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