Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKX8

CAVIN4, Caveolae-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN4Q5BKX8 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ZRSR2-202ENST00000380308 744 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 MAGI2-AS3-204ENST00000426835 738 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 EPS8-207ENST00000540613 2204 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PDCL3P4-201ENST00000489621 720 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 TRAPPC13-202ENST00000399438 3221 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC140479.2-201ENST00000421567 3130 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 OR5M14P-201ENST00000506803 618 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 HAUS8P1-201ENST00000549005 542 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC092944.2-201ENST00000605443 889 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 MIR325HG-202ENST00000626832 598 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 GPR18-201ENST00000340807 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
CAVIN4Q5BKX8 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms