Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 HAUS6P3-201ENST00000456660 1107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP001464.1-201ENST00000457565 323 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PAICSP6-201ENST00000462572 1280 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ENPP7P2-201ENST00000462675 943 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC021074.2-201ENST00000468434 172 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RIIAD1-206ENST00000479191 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01021-205ENST00000514255 545 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC098827.1-201ENST00000514630 667 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC100849.1-202ENST00000517949 562 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ANKRD46-203ENST00000519316 713 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TPM3P3-201ENST00000521343 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IGKV3-25-201ENST00000523155 253 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SERPINA15P-201ENST00000529287 266 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TMEM126B-211ENST00000534341 1273 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SNHG1-212ENST00000539975 955 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NR2F2-AS1-207ENST00000560170 547 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC055874.1-201ENST00000561458 479 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC027277.2-201ENST00000566325 435 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC022558.2-201ENST00000566841 754 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 EIF4A1P9-201ENST00000576035 1207 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MIR4301-201ENST00000577203 66 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01927-201ENST00000582231 712 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FAM95B1-209ENST00000590863 789 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC138035.1-202ENST00000604669 683 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL355994.5-201ENST00000613591 236 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 THRB-AS1-209ENST00000628911 850 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC245369.4-201ENST00000632209 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 LINC01002-219ENST00000632747 621 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CDYLP1-201ENST00000419017 1458 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC092828.1-201ENST00000501211 5391 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MEPE-204ENST00000497649 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HTR2A-201ENST00000378688 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 DHRS9-205ENST00000432060 1652 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CPB2-AS1-204ENST00000606991 3218 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NOS1-206ENST00000618760 12283 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HIPK1-201ENST00000340480 6997 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RAB11A-201ENST00000261890 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 NDUFB4-203ENST00000485064 1426 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC020904.2-202ENST00000614660 1401 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GART-205ENST00000381839 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ZNF677-206ENST00000598513 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PDE4D-210ENST00000503258 2860 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP20-204ENST00000528829 5880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PLA2G2C-201ENST00000247992 453 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 WFDC10B-202ENST00000335769 475 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 KLRG1-202ENST00000356986 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 MRPL55-212ENST00000366739 641 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RGS8-202ENST00000367556 843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-213ENST00000369061 3803 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 PAGE1-201ENST00000376150 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ANKRD39Q53RE8 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms