Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RMRPP5-201ENST00000411156 267 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL133465.1-201ENST00000432942 512 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC069277.2-201ENST00000454211 432 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC026471.4-201ENST00000569291 449 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MIR3189-201ENST00000578735 73 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 VPS39-202ENST00000348544 2661 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LGI1-212ENST00000630184 2936 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 INPP5F-208ENST00000637174 3168 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 IL20-202ENST00000367098 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CHCHD7-203ENST00000396723 1550 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 CPED1-201ENST00000310396 5340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 EIF1B-201ENST00000232905 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MIR1178-201ENST00000408396 91 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 OR5K2-201ENST00000427338 1060 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC073594.1-201ENST00000462065 364 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC068522.1-201ENST00000482895 345 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC064802.1-201ENST00000521523 866 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP002336.3-201ENST00000526017 367 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 LAMTOR5-207ENST00000602858 553 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AC087683.2-201ENST00000611384 326 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 DDAH1-206ENST00000633113 703 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 AL596275.2-208ENST00000641192 594 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
FSCN1Q16658 NHS-202ENST00000398097 8213 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms