Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
FXNQ16595 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PDE4B-206ENST00000423207 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CADM2-202ENST00000405615 1314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CTTNBP2NL-201ENST00000271277 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CMAHP-202ENST00000377993 1681 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC096992.2-201ENST00000609553 1684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC007485.2-201ENST00000623493 1667 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 GFPT1-202ENST00000361060 8632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PCYT1B-201ENST00000356768 1289 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RNA5SP472-201ENST00000363868 119 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PFKFB1-201ENST00000374992 1156 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 SLC6A13-202ENST00000436453 1101 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC108039.2-201ENST00000440214 359 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CRYGGP-201ENST00000443337 145 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SL228P-201ENST00000470060 303 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SL563P-201ENST00000481233 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 RN7SL152P-201ENST00000484176 298 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AMTN-202ENST00000504451 761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ROPN1B-207ENST00000511082 782 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC022441.2-201ENST00000514113 382 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC027031.1-201ENST00000517318 489 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC018953.1-201ENST00000523265 730 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC103974.1-201ENST00000527285 874 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FXNQ16595 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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FXNQ16595 LINC00678-202ENST00000534757 798 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC006205.2-201ENST00000538943 373 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC067735.1-201ENST00000551152 526 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC068254.1-201ENST00000584753 483 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FXNQ16595 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PART1_3.1-201ENST00000619680 131 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
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FXNQ16595 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FXNQ16595 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 LINC02249-202ENST00000562624 4260 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 ZNF227-202ENST00000391961 2993 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FXNQ16595 PRRC1-202ENST00000442138 5504 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
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FXNQ16595 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
FXNQ16595 MCTP2-201ENST00000357742 7555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC129502.1-201ENST00000623261 1654 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PSG5-210ENST00000599812 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 ARL4A-201ENST00000356797 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 S100A5-202ENST00000368718 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 LELP1-201ENST00000368747 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 RPL34-203ENST00000394668 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
FXNQ16595 AL359382.1-201ENST00000417838 426 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
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