Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC079456.1-201ENST00000624010 480 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MIR665-201ENST00000635949 72 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SCFD1-202ENST00000396629 2021 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ART3-203ENST00000355810 1561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SPAG5-AS1-202ENST00000424210 1551 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GIF-201ENST00000257248 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RGS5-201ENST00000313961 5862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ADGRL3-215ENST00000512091 12636 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DTNA-221ENST00000591182 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZEB2-AS1-202ENST00000427278 1322 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PTTG1-201ENST00000352433 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MT-CO3-201ENST00000362079 784 ntAPPRIS P1 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CNTRL-202ENST00000373844 713 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FARP1-202ENST00000376581 1021 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC00342-201ENST00000412393 654 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC013472.2-201ENST00000416226 306 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL357314.1-201ENST00000433521 806 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 LINC00444-201ENST00000435617 215 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CICP10-201ENST00000439497 198 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OSBPL10-AS1-206ENST00000447181 575 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 USP12-AS2-201ENST00000452222 279 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC096915.1-201ENST00000456185 512 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC092903.2-201ENST00000510244 427 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC124242.1-205ENST00000517798 646 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RACGAP1-216ENST00000548961 387 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC061975.4-201ENST00000578466 776 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC090616.1-201ENST00000583895 447 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC008764.3-201ENST00000597357 432 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC008635.1-201ENST00000600716 562 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 MAGEB5-201ENST00000602297 1216 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL136139.1-201ENST00000605568 222 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NQO2-209ENST00000606474 470 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
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VAMP3Q15836 Metazoa_SRP.134-201ENST00000610965 327 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC090099.1-204ENST00000623626 849 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AC017000.1-201ENST00000639380 578 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 CLSPN-202ENST00000318121 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
VAMP3Q15836 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
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