Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,024 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 LINC00615-201ENST00000546725 1406 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 CSPP1-201ENST00000262210 4367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PCM1Q15154 CLCN3-204ENST00000504131 5592 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 ENKUR-205ENST00000615958 3294 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 U3.2-201ENST00000362981 210 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC016395.1-201ENST00000444086 465 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 RN7SL629P-201ENST00000489622 285 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AL008635.1-201ENST00000609073 385 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 PARD3B-213ENST00000614500 7538 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 GKN2-202ENST00000481498 1498 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 RNA5SP132-201ENST00000364725 118 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 MYOCOS-203ENST00000637303 564 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 SPINK14-201ENST00000356972 294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 SPINK14-202ENST00000562793 157 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 CPEB4-202ENST00000334035 6705 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.44□□□□□ -1.54
PCM1Q15154 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC5.44□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms