Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 CCDC80-201ENST00000206423 12430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ZNF268-201ENST00000228289 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ADA2-210ENST00000610390 4137 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CLEC3A-201ENST00000299642 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PLEKHA5-202ENST00000424268 4391 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TMBIM4-201ENST00000286424 989 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AP001610.2-201ENST00000415820 422 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC096754.1-201ENST00000508904 818 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC02147-201ENST00000509367 807 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC106895.1-201ENST00000515825 548 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 OR4A13P-201ENST00000529316 942 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MID1-205ENST00000380785 6092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RACGAP1-221ENST00000551016 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NEXMIF-203ENST00000616200 10624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 CC2D2B-202ENST00000410012 1792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 ATXN10-203ENST00000402380 564 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 KCNJ13-202ENST00000409779 1099 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 UBE2V1P14-201ENST00000415815 558 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RAB3GAP1-202ENST00000425393 1139 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MOCS2-205ENST00000508922 1210 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC011853.2-201ENST00000526901 774 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC007066.2-202ENST00000566531 914 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MOCS2-209ENST00000582677 741 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC020765.1-201ENST00000604296 328 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AP000866.6-201ENST00000638898 3579 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 TLR10-201ENST00000308973 3958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 HABP2-201ENST00000351270 3009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
R3HDM1Q15032 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms