Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RNASE9-203ENST00000429244 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 FCRL2-205ENST00000469986 902 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OSTC-204ENST00000512478 663 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL139354.1-201ENST00000554319 645 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IGFL2-AS1-206ENST00000601263 446 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PCBP1-AS1-282ENST00000625783 826 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PFKFB2-201ENST00000367079 3494 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MRPL47-201ENST00000259038 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MIR27A-201ENST00000385073 78 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 UNC50-203ENST00000409347 1276 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC019205.1-201ENST00000421830 730 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL451164.3-201ENST00000441377 447 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL136460.1-201ENST00000442389 473 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01781-202ENST00000443104 591 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RN7SL502P-201ENST00000481857 290 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC008410.1-201ENST00000483777 339 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC104779.1-201ENST00000503557 441 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 HDAC2-AS2-209ENST00000519270 1244 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC01580-202ENST00000555364 661 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC096553.1-201ENST00000605169 829 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 Metazoa_SRP.77-201ENST00000616915 252 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC091932.2-201ENST00000623014 291 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 OTC-201ENST00000039007 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 NRG3-208ENST00000556918 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SMCO1Q147U7 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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