Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC025423.4-201ENST00000553141 785 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 H3F3BP2-201ENST00000583907 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ZNF227-204ENST00000586228 569 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC109462.4-201ENST00000637882 581 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC016831.1-201ENST00000432045 6411 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 CASP8-203ENST00000323492 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
COL4A6Q14031 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 NOSTRIN-202ENST00000397206 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 CASP1-215ENST00000533400 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ABCA1-202ENST00000374736 10494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ADTRP-201ENST00000229583 891 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC068138.1-201ENST00000412635 217 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 SS18L2P2-201ENST00000583960 235 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC060766.1-201ENST00000590824 627 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 HSPD1P7-201ENST00000447985 1686 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 BTBD10-210ENST00000530907 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 LMO7-202ENST00000341547 7237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ATP2B4-204ENST00000367218 8918 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 GSTM5P1-201ENST00000434751 660 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 RN7SL205P-201ENST00000490174 284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 SERPINB11-205ENST00000544088 1846 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC006511.5-202ENST00000546339 1198 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC078814.2-201ENST00000552996 535 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 CASC19-243ENST00000641588 1546 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 DSC1-202ENST00000257198 4225 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC013268.3-201ENST00000262716 2324 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 ADAMTS9-201ENST00000295903 7060 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 PPP1R12B-216ENST00000608999 15248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AL117378.2-201ENST00000622916 1337 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 RNF212B-201ENST00000399905 1071 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 LINC01291-202ENST00000418204 441 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 Z92846.1-201ENST00000456203 268 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
COL4A6Q14031 AC021106.1-201ENST00000509020 1058 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms