Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 FXN-205ENST00000498653 856 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 DUTP7-201ENST00000507982 486 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AP003028.1-203ENST00000525832 444 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC018690.1-201ENST00000608144 626 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AP001885.1-201ENST00000621658 558 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OR6C71P-202ENST00000641886 1107 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AGBL1-201ENST00000441037 3551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC067956.1-201ENST00000414512 2062 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 CLCC1-205ENST00000369969 4343 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RIMS1-219ENST00000523963 3097 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC01920-201ENST00000441356 2528 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ENTPD1-AS1-202ENST00000416301 4241 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
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TCIRG1Q13488 RAD54B-201ENST00000297592 1879 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 NBPF25P-202ENST00000619932 3827 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 QRSL1-202ENST00000369046 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 HSDL2-201ENST00000398803 2983 ntTSL 1 (best) BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 FLJ12825-201ENST00000515617 3942 ntTSL 2 BASIC7.32□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 DMD-202ENST00000343523 5623 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MEF2C-226ENST00000625674 4343 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC02119-201ENST00000508853 2573 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 FGG-205ENST00000407946 1636 ntTSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 MIR365B-201ENST00000362317 111 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 AC007068.1-201ENST00000396690 844 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
TCIRG1Q13488 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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