Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC046158.2-201ENST00000568764 707 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC040170.1-201ENST00000602425 564 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC048341.3-201ENST00000619323 491 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR5R1-201ENST00000623286 975 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC127070.3-201ENST00000503695 3263 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 FOXJ3-209ENST00000545068 5165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PDE6A-205ENST00000617647 4039 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CTNND1-216ENST00000527467 5071 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NUP93-202ENST00000542526 8257 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 EIF4ENIF1-205ENST00000397523 3420 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 KCNJ1-203ENST00000392664 1674 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SP110-204ENST00000392048 1937 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CEACAM20-205ENST00000620096 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 CNTNAP4-209ENST00000622250 3783 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PSMD10-206ENST00000372296 878 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RN7SKP129-201ENST00000410288 299 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC104823.1-201ENST00000413290 989 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC00440-201ENST00000446579 734 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SNORA58-201ENST00000505219 137 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC127526.3-201ENST00000534291 450 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC068643.2-201ENST00000547418 852 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC090115.2-201ENST00000548060 883 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL161757.4-202ENST00000557467 737 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 PWRN1-210ENST00000568045 1299 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC005291.1-201ENST00000577743 641 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 SPANXN5-201ENST00000375511 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 OR2J3-201ENST00000377169 1325 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
AP3B2Q13367 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms