Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ALDH7A1P4-201ENST00000412255 178 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC00266-1-202ENST00000425473 629 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 BBS9-205ENST00000425508 1252 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL450003.1-201ENST00000439447 455 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MAGEC3-203ENST00000443323 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LAMTOR5-AS1-201ENST00000444238 881 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CFTRP1-201ENST00000456646 183 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SNORA35.1-201ENST00000458908 128 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RPL34P34-201ENST00000465389 354 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MRPS33-203ENST00000467334 622 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MYL6P4-201ENST00000477911 453 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC021006.1-201ENST00000489849 553 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 RNA5SP518-201ENST00000515957 119 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC022639.1-204ENST00000520365 569 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ACRV1-203ENST00000530048 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02378-201ENST00000540399 1003 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC090774.2-201ENST00000584708 322 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC024451.4-201ENST00000602578 752 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL031429.2-201ENST00000602605 649 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC090181.2-201ENST00000602975 672 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL512430.4-201ENST00000603085 613 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.106-201ENST00000622471 296 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZRANB2-AS2-220ENST00000623721 1133 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SKIV2L-216ENST00000628157 210 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC063952.1-203ENST00000634410 658 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP002800.1-201ENST00000624982 2225 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 CASP5-201ENST00000260315 1414 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 MKI67P1-201ENST00000604297 1460 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 GAPVD1-215ENST00000470056 8923 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF532-224ENST00000591808 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 ZNF438-201ENST00000331737 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AP004289.1-201ENST00000436307 2205 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 SRGAP1-206ENST00000543397 5652 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
CHRNEQ04844 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TBC1D32-201ENST00000275159 4431 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 OR5A1-201ENST00000302030 1051 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 TRBV24OR9-2-201ENST00000416632 435 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL162582.1-201ENST00000419196 467 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 EIF1P1-201ENST00000421436 341 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 CHCHD3P1-201ENST00000425516 676 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC097721.1-201ENST00000427150 1253 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HNRNPA1P57-201ENST00000431359 530 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CHRNEQ04844 AL033379.1-201ENST00000442184 481 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms