Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 RN7SKP161-201ENST00000411110 305 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 LINC01829-201ENST00000414404 571 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC073464.3-201ENST00000422564 712 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 SNX18P26-201ENST00000458433 740 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 SLC24A5-204ENST00000482911 2984 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 RPL32P9-201ENST00000487963 407 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 C5orf64-204ENST00000507461 535 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 CHCHD7-209ENST00000519367 442 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AP003400.2-201ENST00000624036 666 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
EPHB4P54760 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 KCNAB1-212ENST00000490337 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC011815.2-201ENST00000618230 2021 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 ZNF813-201ENST00000396403 6151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 THAP6-201ENST00000311638 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 NBPF12-204ENST00000613714 2701 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 OR6C75-202ENST00000641576 4569 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 FAM26D-203ENST00000405399 1165 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL163193.1-201ENST00000444895 788 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 SEPT7P6-201ENST00000469999 1143 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC02404-201ENST00000546710 1188 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC010401.2-202ENST00000570663 396 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC027334.1-201ENST00000603257 310 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
EPHB4P54760 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
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