Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ADAM29-213ENST00000615367 3386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SLMAP-203ENST00000383718 6749 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 GRIK2-207ENST00000421544 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 NEDD9-202ENST00000379446 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 C14orf2-211ENST00000557040 472 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC005154.2-201ENST00000438110 379 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC011005.3-201ENST00000491624 395 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL359715.3-201ENST00000569267 2123 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SLC7A2-201ENST00000004531 7560 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TP53BP1-201ENST00000263801 6346 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 HTR2A-203ENST00000543956 4689 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 POLA1-202ENST00000379068 5486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ECT2-206ENST00000417960 4363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PEG10-206ENST00000612941 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PEG10-209ENST00000617526 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF626-203ENST00000601440 5963 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 BZW1P1-201ENST00000454901 1240 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PTPN20-212ENST00000502254 599 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC011497.2-201ENST00000600255 639 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 HEPH-202ENST00000343002 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
CENPFP49454 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TMEM236-201ENST00000377495 5464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC034105.4-201ENST00000568304 277 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PRLR-212ENST00000513753 1525 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 GPM6A-201ENST00000280187 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CENPFP49454 PARN-201ENST00000341484 2100 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC091976.1-201ENST00000458002 448 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CENPFP49454 AC073869.8-201ENST00000641806 335 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms