Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL158827.1-201ENST00000416300 391 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC073465.2-201ENST00000440938 498 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL672138.1-201ENST00000450604 1015 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 LINC01365-202ENST00000512219 637 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 OR4C13-201ENST00000555099 1029 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 AL049767.1-202ENST00000637826 242 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
PTPRCP08575 SPARCL1-202ENST00000418378 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 IGSF6-201ENST00000268389 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 DNM1P47-203ENST00000571780 12667 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC105399.1-202ENST00000447303 205 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC068489.1-201ENST00000453706 261 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC02505-202ENST00000510597 776 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AP001266.2-201ENST00000534505 464 ntTSL 4 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01243-201ENST00000562065 721 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AP2S1-210ENST00000601649 315 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC007204.2-201ENST00000615022 616 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC245100.4-204ENST00000635587 1555 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LRRN3-204ENST00000451085 3725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ATP5A1P1-201ENST00000454088 1321 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 DLEU7-AS1-201ENST00000413510 1806 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC008269.1-201ENST00000438070 646 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 C21orf91-OT1-203ENST00000439392 497 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MYLK-AS2-201ENST00000510827 500 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC6.95□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.94□□□□□ -1.3
PTPRCP08575 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms